علوم الطبيعة والحياة · العلاقة بين بنية ووظيفة البروتين

الأحماض الأمينية والسلوك الأمفوتيري

كيف تحدد المقارنة بين pH الوسط ونقطة pHi شحنة الحمض الأميني واتجاه هجرته الكهربائية

  • علوم تجريبية مهم
  • رياضيات مهم

8 دقيقة

ما يطلبه منك البرنامج

  • 20 حمضاً أمينياً (H2N-CH(R)-COOH، الجذر R يميّز)
  • التصنيف: حمضية (Asp/Glu)، قاعدية (Lys/Arg/His)، متعادلة (15)
  • السلوك الأمفوتيري ونقطة التعادل الكهربائي pHi
  • الهجرة الكهربائية: pH<pHi→موجب→مهبط؛ pH>pHi→سالب→مصعد؛ pH=pHi→متعادل
  • الرابطة الببتيدية (تكاثف −H2O، قراءة من النهاية الأمينية إلى الكربوكسيلية)

الطريقة

  1. توقّع جهة الهجرة من مقارنة pH بـ pHi
  2. ترتيب pHi انطلاقاً من نتائج الهجرة الكهربائية
  3. تكوين ببتيد + قطع بالـ trypsine

القوانين

  • pH < pHi ⟹ شحنة موجبة ؛ pH > pHi ⟹ شحنة سالبة ؛ pH = pHi ⟹ متعادل

الأخطاء الشائعة

  • خطأ إشارة الشحنة عند pH>pHi
  • عكس اتجاه القراءة N→C
  • الخلط بين الهيكل والجذور R

نوع التمرين الذي يأتي في الباك

  • électrophorèse à pH donné متوسط

    شريط هجرة → استنتاج الشحنة وترتيب pHi

من الدرس

عشرون حمضا أمينيا مختلفا تدخل في بناء كل بروتينات الكائنات الحية. فما الذي يجعلها عشرين نوعا لا نوعا واحدا، رغم اشتراكها كلّها في نفس الهيكل الأساسي؟

المصطلحات

  • حمض أميني (acide aminé)
  • الأمفوتيرية (amphotère)
  • نقطة التعادل الكهربائي pHi
  • الهجرة الكهربائية (électrophorèse)
  • زفيتريون (zwitterion)

ما لا يدخل في البرنامج

  • حسابات pKa
  • Henderson-Hasselbalch

يُبنى على